Высокопроизводительный секвенатор NexSeq 500 Sequencing System

Принцип работы основан на массовом параллельном секвенировании миллионов фрагментов ДНК по технологии секвенирования методом синтеза (sequencing by synthesis, SBS) с использованием флуоресцентно-меченных нуклеотидных зондов. Все процессы секвенирования (клональная амплификация, секвенирование, биоинформатический анализ) полностью автоматизированы и реализованы внутри одного прибора. Программное обеспечение BaseSpace OnSite в автоматическом режиме обрабатывает данные, а также позволяет хранить и обмениваться результатами исследования. За один запуск NextSeq 500 способен секвенировать 120 млрд. п.о. ДНК с количеством чтений свыше 800 млн., что обеспечит секвенирование одного полного генома человека в 30-кратном покрытии.

 Решаемые задачи

• Секвенирование геномов de novo и ресеквенирование (1 геном человека в 30-кратном покрытии за запуск)

• Секвенирование экзома (до 16 экзомов человека/запуск)

• Секвенирование транскриптома (до 20 транскриптомов/запуск)

• Секвенирование мРНК (до 40 образцов/запуск)

• Целевое секвенирование участков генома (до 96 образцов/запуск) 

• Эпигенетические исследования    

• Анализ метилирования ДНК

• Иммунопреципитация хроматина с последующим секвенированием (ChIP-Seq)

• Метагеномные исследования 

Основные характеристики

• Образец пропускной способности, до 16 экзомов, 20 транскриптомов, 96 целевых панелей, 40 образцов профилей экспрессии;

• Составные части, внутренний компьютер управления прибором содержит RFID-метку для отслеживания расходных материалов. Запросите более подробную информацию;

• Длина чтения, 75 п.н., 150 п.н.;

• Максимальное чтение, 100-1000 млн;

• Максимальный выход, 100-1000 Гб;

• Время выполнения, 11-29 часов;

• Анализ данных, Mid Output: 130 M чтения (одиночный), 260 M (парный конец), выход 39 Gb. Высокий выход: 400 млн считываний (одиночный), 800 млн (парный), выход 120 Гбайт;

• Габаритные размеры, Ш×Г×В, 53,3×63,5×58,4 см (21,0×25,0×23,0 дюйма).