Высокопроизводительный секвенатор NexSeq 500 Sequencing System

Производитель: Illumina (США)
Год ввода в эксплуатацию: 2015
Метрологическое сопровождение: Не поверяется

Принцип работы основан на массовом параллельном секвенировании миллионов фрагментов ДНК по технологии секвенирования методом синтеза (sequencing by synthesis, SBS) с использованием флуоресцентно-меченных нуклеотидных зондов. Все процессы секвенирования (клональная амплификация, секвенирование, биоинформатический анализ) полностью автоматизированы и реализованы внутри одного прибора. Программное обеспечение BaseSpace OnSite в автоматическом режиме обрабатывает данные, а также позволяет хранить и обмениваться результатами исследования. За один запуск NextSeq 500 способен секвенировать 120 млрд. п.о. ДНК с количеством чтений свыше 800 млн., что обеспечит секвенирование одного полного генома человека в 30-кратном покрытии.

 Решаемые задачи

·        Секвенирование геномов de novo и ресеквенирование (1 геном человека в 30-кратном покрытии за запуск)

·        Секвенирование экзома (до 16 экзомов человека/запуск)

·        Секвенирование транскриптома (до 20 транскриптомов/запуск)

·        Секвенирование мРНК (до 40 образцов/запуск)

·        Целевое секвенирование участков генома (до 96 образцов/запуск) 

·        Эпигенетические исследования    

- анализ метилирования ДНК

- иммунопреципитация хроматина с последующим секвенированием (ChIP-Seq)

·        Метагеномные исследования 


Основные характеристики

Количество проточных ячеек: 1

Общая производительность:

Версия реагентов

Mid Output

High Output

Количество чтений, млн

до 130

до 400

Максимальная длина чтения

2x150

2x150

Максимальная производительность, Gb

32,5-39

100-120


Режим работы

Длина чтения, п.о.

Производительность, млрд. п.о. (Gb)

Общее время

Качество данных

Режим высокой производительности
Количество парноконцевых чтений ДНК:
> 800 млн. чтений

2 х 150

100 – 120 Гб

~ 29 часов

> 75% оснований качества свыше Q30* при длине чтения 2х150 п.о.

2 х 75

50 – 60 Гб

~ 18 часов

1 х 75

25 – 30 Гб

~ 11 часов

Режим средней производительности
Количество парноконцевых чтений ДНК:
> 260 млн. чтений

2 х 150

32 – 39 Гб

~ 26 часов

2 х 75

16 – 19 Гб

~ 15 часов



Услуги